2011年11月01日 成立 靶向药物临床研究专项基金管理委员会，2021年04月16日靶向药物临床研究专项基金 更名为 癌症防治发展专项基金，成立癌症防治发展专项基金管理委员会；主任委员：崔宝善；支持开展靶向药物研究、肿瘤靶向治疗、细胞治疗应用研究活动，癌症防治科普宣传公益活动。
2012年09月23日 成立 功能医学发展专项基金管理委员会，2015年02月08日 提前换届成立第二届专项基金管理委员会；主任委员：吴非；支持开展功能医学理论研究、慢性病营养与运动干预研究、相关学术交流和人才培训、功能医学科普知识传播等公益活动。
2013年01月08日成立老年医学发展专项基金管理委员会，2018年02月08日换届成立第二届专项基金管理委员会；主任委员：李小鹰；支持开展中国老年医学科标准化建设、老年医学科医师培训、举办中国老年医学和老年健康产业大会、相关指南共识撰写与推广等公益活动。
2011年08月01日 成立 老年颐养专项基金管理委员会，2016年8月30日 换届 成立第二届专项基金管理委员会；主任委员：席小平；支持开展老年健康生活方式、心理健康、健康知识传播、老年健康管理人才培训和相关学术交流等公益活动。
2008年11月01日 成立 血栓与血管专项基金管理委员会，2014年6月项基金管理委员会完成换届；主任委员：常映明；支持开展血栓与血管疾病防治技术研究、适宜技术与产品应用推广、血管疾病规范化诊疗、相关学术交流与人才培训、血管健康科普宣传等公益活动。
2014年12月21日 成立 消化病防治专项基金管理委员会；主任委员：常映明；支持开展消化系统疾病预防、规范化治疗、适宜技术和产品研究与推广、相关学术交流和人才培训等公益活动。
2016年7月27日 在京成立细胞与基因治疗专项基金管理委员会；主任委员：陈 虎；支持开展细胞与基因治疗临床研究、抗衰老应用研究和成果转化，开展细胞与基因治疗相关学术交流和人才培训，开展患者救助等活动。
2018年04月13日 成立 女性“两癌”防治专项基金管理委员会；主任委员：徐卸古；支持开展女性两癌早期筛查和早诊早治工作、女性两癌早期筛查早诊早治适宜技术应用研究与推广、相关学术交流、人才培训和科普宣传等公益活动。
2018年05月24日 成立 心脏影像及心脏干预专项基金管理委员会；主任委员：常映明；支持开展心脏影像及心脏健康干预应用研究、成果转化、学科建设、相关学术交流和人才培训等公益活动。
2018年05月28日 成立 医疗机构服务能力建设专项基金管理委员会；主任委员：张慧洋；支持开展医疗机构服务能力建设、相关临床科学研究、学术交流和专业技能培训等公益活动。
2018年06月22日 成立慢性呼吸疾病防治专项基金管理委员会；主任委员：徐卸古；支持开展慢性呼吸道疾病预防、临床规范化诊疗、慢性呼吸道疾病患者康复训练辅导、相关学术交流和人才培训、健康科普等公益活动。
2017年10月17日 成立 药房服务发展专项基金管理委员会；主任委员：徐卸古；支持开展药师参与实施慢病管理人才培养、相关学术交流、患者关爱与健康教育公益活动。
2019年3月18日 成立网络科普与文化专项基金管理委员会；主任委员：徐卸古；支持开展健康中国行动相关健康科普视频资料编导、制作与网络传播、相关 学术交流和人才培养公益活动。
2019年03月27日 成立 精准营养专项基金管理委员会；主任委员：徐卸古；支持开展精准营养科学研究和成果转化、相关学术交流、人才培训和科普宣传等公益活动。
2019年04月22日 成立 生殖健康专项基金管理委员会；主任委员：徐卸古；支持开展生殖健康生物医药研究与成果转化、相关学术交流、科普知识传播等公益活动。
2019年04月23日 成立 糖尿病防治专项基金管理委员会；主任委员：徐卸古；支持开展糖尿病早期检测适宜技术应用研究、探索糖尿病专科医健体建设、相关学术交流、人才培训和科普宣传等公益活动。
2019年09月18日 成立 医学交流直播专项基金管理委员会；主任委员：常映明；支持开展互联网医学交流直播平台建设、开展互联网医学继续教育、学术交流、患者健康教育等公益活动。
2019年09月19日 成立 数字健康发展专项基金管理委员会；主任委员：徐卸古；支持开展互联网、人工智能、智慧管理和健康险在慢病管理中应用研究、多服务层级慢病管理多中心应用研究、探索数字健康服务体系建设、相关学术交流和人才培训等公益活动。
2019年12月11日 成立 慢性病康复专项基金管理委员会；主任委员：徐卸古；支持开展慢性病康复中医药适宜技术与相关产品的研究与开发、慢性病康复管理相关学术交流、专业人员培训和科普知识传播等公益活动。
2019年12月30日 成立 儿童青少年健康促进专项基金管理委员会；主任委员：徐卸古；支持开展儿童青少年健康教育、普及控烟、近视预防、科学营养、合理运动、心理健康、青春期保健、疾病预防、健康生活方式养成等相关公益活动。